[2022] OpenTargets platform을 활용한 신약 물질탐색(개설 준비중) Certificate
Recruiting People1,000 people
Enrollment Period01-01-1970 ~ 01-01-1970
Learning period10-03-2022 ~ 12-31-2022
9월 개설 예정입니다.
강의 소개 및 개요입니다.
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성명 |
한남식 |
소속기관 |
케임브리지대학교 |
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과목명 |
OpenTargets platform을 활용한 신약 물질탐색 |
강의시간 |
2 |
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학습목표 |
EMBLEBI가 다국적제약사들과 공동연구를 통하여 개발한 Open Targets 플랫폼은 open source이며 user-friendly web interface를 제공하여 유전자와 질병간에 연관성을 분석할 수 있게 해준다. NHGRI-EBI GWAS Catalog. Genomics England, PheWAS, ClinVar. Expression Atlas, UniProt, ChEMBL 등과 같은 공개된 대용량데이터베이스들을 통합하여 생물학적 데이터들을 모두 연결시켜 놓아 사용자들이 질병연관성을 용이하게 분석할 수 있 게 해준다. 근래에는 human cellular models (eg organoids. iPSCs)과 genome editing (CRISPR/Cas9) 데이터들을 생산하여 추가함으로써 drug targets 발굴이 가능하다. 본 강의 는 Open Targets 플랫폼을 이해하고 실제로 연구에 활용 할 수 있도록 이론 및 실습형으로 진행한다. |
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강의 선수과목 및 준비사항입니다.
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선수과목 |
필요없음 |
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참고자료 |
https://doi.org/10.1093/nar/gkyl133 |
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준비사항 |
https://platform opentargets.org |
OpenTargets platform을 활용한 신약 물질탐색 강의 과정입니다.
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이론 강의에서는 아래 내용들에 대해 이루어 짐 The Open Targets partnership and its goals The Open Targets Platform and the integration of the genomic datasets and drug information How to visualise and interpret gene-disease associations using the Open Targets Platform
How to browse gene, protein, genetic variants (and much more) in the context of human diseases Alternatives ways of accessing this data eg. REST-API
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실습은 아래 항목들에 대해 수강생들이 OpenTargets 플랫폼을 활용해 분석함 Find diseases, phenotypes and traits associated with human genes Find genes associated with diseases, phenotypes and traits Get information on protein, genetic variation, gene expression, gene 실습 ontology. drugs. pathways (and more) for a gene Retrieve a list of publications supporting target and disease association
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