protein data bank 분석 수료증
모집인원999명
수강신청기간2024-03-01 ~ 2024-12-31
학습기간2024-03-01 ~ 2024-12-31
강의 소개 및 개요입니다.
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성명 |
홍승환 |
소속기관 |
한국제약바이오협회 |
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과목명 |
protein data bank 분석 |
강의시간 |
3 |
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학습목표 |
(1) Protein Data Bank로부터 pdb 단백질 3D 구조 파일을 얻고, pdb 파일을 파싱하는 방법에 대해 설명한다. (2) pdb 구조로부터 단백질-리간드 상호작용을 분석한다. (3) 단백질 데이터베이스 Uniprot에서 제공하는 정보에 대해 설명하고, 신약개발에 활용하는 방법을 알아본다. |
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강의 선수과목 및 준비사항입니다.
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선수과목 |
단백질 구조 결정학, 단백질 구조기반 신약설계 |
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참고자료 |
도서, 웹사이트, 논문 등 |
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준비사항 |
linux (windows WSL), Python, Anaconda |
protein data bank 분석 강의 과정입니다.
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1 |
Protein Data Bank (PDB) 에 대해 소개한다. Protein Data Bank (PDB) 에 대해 소개한다. pdb 단백질 구조 파일 포맷을 설명한다. pymol을 사용하여 단백질 구조를 확인한다. pdb 단백질 구조 파일 실습 1. pdb to sequence 2. pdb to distance map 3. protein-ligand 파일 분리 |
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2 |
Uniprot에 대해 소개한다. protein bioinformatics (PBI) toolkit을 이용하여 pdb 구조를 전처리하고 단백질-리간드 상호작용을 분석한다 |