protein data bank 분석 수료증

  • 모집인원999명

  • 수강신청기간2024-03-01 ~ 2024-12-31

  • 학습기간2024-03-01 ~ 2024-12-31

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강좌 소개

강의 소개 및 개요입니다. 

성명

홍승환

소속기관

한국제약바이오협회

과목명

protein data bank 분석

강의시간

3

학습목표

(1) Protein Data Bank로부터 pdb 단백질 3D 구조 파일을 얻고, pdb 파일을 파싱하는 방법에 대해 설명한다.

(2) pdb 구조로부터 단백질-리간드 상호작용을 분석한다.

(3) 단백질 데이터베이스 Uniprot에서 제공하는 정보에 대해 설명하고, 신약개발에 활용하는 방법을 알아본다.

 

강의 선수과목 및 준비사항입니다.

선수과목

단백질 구조 결정학, 단백질 구조기반 신약설계

참고자료

도서, 웹사이트, 논문 등

준비사항

linux (windows WSL), Python, Anaconda

 

과정 소개

protein data bank 분석 강의 과정입니다. 

1

Protein Data Bank (PDB) 에 대해 소개한다.

Protein Data Bank (PDB) 에 대해 소개한다.

pdb 단백질 구조 파일 포맷을 설명한다.

pymol을 사용하여 단백질 구조를 확인한다.

pdb 단백질 구조 파일 실습

1. pdb to sequence

2. pdb to distance map

3. protein-ligand 파일 분리

2

Uniprot에 대해 소개한다.

 protein bioinformatics (PBI) toolkit을 이용하여 pdb 구조를 전처리하고 단백질-리간드 상호작용을 분석한다

분류
  • 주제
    화합물데이터
  • 분야
    화학 & 화학정보학
  • 실습
    프로그래밍 (Python)
  • 활용 단계
    Drug Discovery
교수자/개설자