신약 타겟 발굴을 위한 Exome 시퀀싱의 활용 수료증

  • 모집인원999명

  • 수강신청기간2024-03-01 ~ 2024-12-31

  • 학습기간2024-03-01 ~ 2024-12-31

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강좌 소개

성명

김상수

소속기관

숭실대학교

과목명

신약 타겟 발굴을 위한 exome 시퀀싱의 활용

강의시간

4

학습목표

대규모 인구 집단의 유전체 서열 분석을 통해서 신약 타겟을 발굴한 사례를 리뷰하고, 이 에 관련된 생명정보학 기술에 대한 이론적 소개와 함께, 공개된 데이터 및 분석 소프트웨어 를 활용한 실습을 통하여, 유전체학 기반 신약 개발의 기초를 닦음.

 
과정 소개

1

Biopharmaceutical 회사인 Regeneron의 유전체연구소에서 64만명의 인구 집단을 대상으로 exome 시퀀싱을 실시하여, GPR75 유전자의 희귀 돌연변이를 갖는 사 람들은 비만하지 않다는 사실을 확인하여, 2021년 사이언스지에 발표하였음. 이 논문을 리뷰하여, 관련 생명정보학 이론 및 기술을 소개함

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2

유전체 정보, 유전자/단백질 서열 및 변이 데이터베이스에 대한 간단한 소개 및 활용법을 실습을 통해 익힘. 또한, 이들 데이터베이스에 대한 체계적 데이터마이 닝을 위한 API 접근법을 실습함 (R/Bioconductor 이용).

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3

차세대염기서열분석법 (NGS)의 기본 개념에 대한 소개, 서열 데이터의 형식, 참 조 게놈 매핑 및 결과 가시화 등을 예제 데이터를 이용하여 실습함 (리눅스 시 스템).

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4

Exome 시퀀싱 및 변이 발굴의 개념을 소개하고, 예제 데이터를 활용하여 변이 발굴 및 변이별 단백질 기능에 미치는 영향 예측을 실습함.

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선수과목

 

참고자료

- DOI: 10.1126/science.abf8683 (1강)

준비사항

- 리눅스 환경 (서버 혹은 가상 머신) 메모리 5Gb 이상, 100Gb 이상 하드디스크

Keyword

bioinformatics NGS exome rare variants target identification

 
분류
  • 주제
    유전체학
  • 분야
    생물학 & 생물정보학
  • 실습
    프로그래밍 (Python)
  • 활용 단계
    Target Identification
교수자/개설자