인공지능 신약개발을 위한 그래프 기초 Certificate

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  • Enrollment Period03-01-2024 ~ 12-31-2024

  • Learning period03-01-2024 ~ 12-31-2024

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Class Introduction

인공지능 신약개발을 위한 그래프 기초 강의 과정입니다, 

성명

방준일

소속기관

강원대학교

과목명

인공지능 신약개발을 위한 그래프 기초

강의시간

5

학습목표

1. 그래프의 정의와 그래프 신경망을 이해한다.

2. 탐색적 데이터 분석(EDA)을 통해 그래프 데이터 표현 방법을 이해한다.

3. 논문 코드 구현을 통해 단백질-약물 상호작용(DTI) 예측 모델을 이해한다.

 

강의 선수과목 및 준비사항입니다.

선수과목

- 파이썬 프로그래밍 기초

- 파이썬 딥러닝 프레임워크

- GPU를 활용한 딥러닝(선택)

참고자료

- (논문) GraphDTA: predicting drug-target binding affinity with graph neural networks

준비사항

- 실습은 Google Colab으로 진행하므로, 교육생별 Google 계정이 필요함

 

Course Introduction

인공지능 신약개발을 위한 그래프 기초 강의 과정입니다,

1

인공지능 신약개발을 위한 그래프 기초

1. DTI(Drug-Target Interaction)의 정의

2. 그래프의 정의 : 통계적 그래프와 수학적 그래프

3. 그래프의 활용 : 실생활에서의 그래프와 신약개발에서의 그래프

4. 그래프 데이터 구조 기초

2

DTI를 위한 약물 및 표적 데이터 표현

1. DTI 데이터 표현 : Drug to graph representation

2. DTI 데이터 표현 : Target to label encoding representation

3. DTI의 벤치마크 데이터세트 : DAVIS and KIBA

3

DTI에 그래프를 적용하기 위한 그래프 신경망 기초

1. GNN(Graph Neural Network)

2. GCN(Graph Convolution Network)

3. GAT(Graph Attention Network)

4. GIN(Graph Isomorphism Network)

4

DTI를 위한 약물 및 표적 데이터 표현 실습(Colab)

1. 그래프 표현을 위한 파이썬 라이브러리 활용

2. 약물 및 표적 데이터 표현을 위한 파이썬 라이브러리 활용

3. 벤치마크 데이터 전처리 및 구조 파악

5

DTI에 그래프를 적용하기 위한 그래프 신경망 실습(Colab)

1. 코드 구현을 통한 그래프 신경망(GCN, GAT, GIN) 구조 파악

2. 벤치마크 데이터를 통한 모델 학습

3. 모델 학습 결과 시각화

Classification
  • Subject
    Machine Learning
  • Class Area
    AI & Programming
  • Practice
    Programming (Python)
  • Utilize
    기타
Professor