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90 Course(s)

Professor

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Learning Period

11-25-2022 ~ 03-31-2023

Course Introduction

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Students

27

신약개발과정|

[2022] 신약개발을 위한 유기화학개론 (강의 추가 예정)

Professor

LAIDD관리자

Learning Period

09-01-2022 ~ 03-31-2023

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다.  성명 김선, 이도훈 소속기관 서울대학교 과목명 인공지능을 활용한 멀티오믹스 기반 바이오마커 발굴 강의시간 2 강의 소개 본 강의는 총 2강으로 구성된다. 제 1강 “멀티오믹스 바이오마커의 주요 원리 및 연구 동향 소개” 에서는 유전체(genome), 전사체(transcriptome), 후성유전체(epigenome), 단백체(proteome) 및 생물학적 네트워크(biological network) 관점의 특성이 바이오마커로 기능할 수 있는 원리를 알아보고, 관련 연구 동향을 소개한다. 제 2강 “멀티오믹스 바이오마커 발굴을 위한 인공지능/기계학습 방법론 및 대규모 데이터베이스 소개” 에서는 전통적 기계학습, 네트워크 기반 알고리즘, 그리고 인공지능에 기반한 바이오마커 발굴 방법론들을 계산적 측면에서 심도있게 다루며, 나아가 해당 방법론의 적용을 위한 대규모 생물학 데이터베이스들을 포괄적으로 소개한다. 강의 목적 멀티오믹스 바이오마커의 주요 원리와 연구 동향을 파악하고, 바이오마커 발굴을 위한 인공지능/기계학습 방법론 및 대규모 생물정보 데이터베이스를 포괄적으로 학습하여 이를 실제 연구에 적용할 수 있는 기본 능력을 배양한다.

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114

Starting
[2022] 인공지능을 활용한 멀티오믹스 기반 바이오마커 발굴
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생물정보학|

오믹스 분석|

[2022] 인공지능을 활용한 멀티오믹스 기반 바이오마커 발굴

Professor

LAIDD관리자, 신현길

Learning Period

09-01-2022 ~ 03-31-2023

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다.  성명 신현길 소속기관 안전성평가연구소 과목명 독성 예측 인공지능 모델 활용 강의시간 6시간 학습목표 1. 무료로 사용 가능한 독성 예측 프로그램 설치 및 활용 방법 익히기 2. python을 이용한 데이터 분석 및 처리 방법 익히기 3. 예측 모델 개발을 위한 python 코드 완성해보기   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 파이썬 프로그래밍 기초(2-5강), 화학정보학개론, QSAR, RDKit의 기초와 이를 이용한 화학정보학 실습 참고자료 RDKit의 기초와 이를 이용한 화학정보학 실습 [강사 강원대학교 이주용] 1. 컴퓨터를 이용한 신약 개발 방법론 https://www.ibric.org/myboard/list.php?Board=news&Page-2&&PARA3-21) 2. pubchempy (https://pubchempy.readthedocs.io/en/latest/) 3. openbabel 파이썬 모듈 http://openbabel.org/wiki/python) 참고자료 4. MOPAC 홈페이지 (http://openmopac.net/) 5. Chembl 데이터베이스 (https://www.ebi.ac.uk/chembin 6. binding DB (https://www.bindingdb.org/rwd/bind/index.jsp) 7. DILIrank 미국 FDA에서 정리한 데이터 베이스 (classificaion 모델 개발용 데이터) https://www.fda.gov/science-research/liver-toxicity-knowledge-base-ltkb/drug-induced-liver-in jury-rank-cdilirank-dataset) 준비사항 아나콘다 파이썬으로 진행(아나콘다 파이썬이 아닌 경우 pandas, matplotilb, sci-kit learn 모듈 추가 설치 필요) 아나콘다 파이썬에서 추가 설치가 필요한 모듈 (pubchempy, mopac, openbabel, joblib) 아나콘다에서 제공하는 spyder 사용방법 숙지(다른 IDE 호라용해도 문제 X) text editor 프로그램(Atom, Sublime 등) binding DB 데이터 활용을 위한 홈페이지 가입 필요

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60

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리간드 기반 약물탐색|

[2022] 독성예측인공지능 모델 활용
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