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Learning Period

03-01-2024 ~ 12-31-2025

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다. 성명 김태민 소속기관 가톨릭대학교 과목명 Cancer genome analysis 강의시간 5 학습목표 1. 암유전체의 대표적인 변이 중 돌연변이(mutation) 및 염색체변이(copy number alteration)에 대한 정의 및 대표적인 연구기법 등을 학습한다.   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 NGS data analysis, Genomics analysis, Big data in precision oncology 참고자료   준비사항  R+ 기반 실습과목

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03-01-2024 ~ 12-31-2025

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다.  성명 김상우 소속기관 연세대학교 과목명 Genomic Analysis (SNV, SV, CNV) 강의시간 5 학습목표 1. NGS 데이터로부터 다양한 유전자 변이를 탐지해 낼 수 있다2. NGS 데이터로부터 유전 변이를 찾아내는 이론을 이해하고, 정확한 결과를 도출할 수 있다   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 서열분석 (Sequencing Analysis) (기초), Introduction to NGS data analysis (중급)  참고자료 x 준비사항  x

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03-01-2024 ~ 12-31-2025

Course Introduction

강의시간 강의내용 실습여부 1 유전변이 데이터 기본 유전변이의 개념과 종류 유전변이 데이터의 수집과 저장 방법 N 2 유전변이 annotation과 약물 유전자 데이터베이스 유전변이 annotation 방법 소개 약물 유전자 데이터베이스의 활용 방법 N 3 암유전체를 이용한 약물유전체 분석 실습 1 암과 관련된 유전체 데이터의 수집과 분석 방법 약물유전체 분석에 활용되는 도구와 기술 Y 4 암유전체를 이용한 약물유전체 분석 실습 2 암유전체 분석을 통한 약물 효능 예측 방법 유전체 변이 데이터를 활용한 개인 맞춤형 약물 치료 방법 Y 5 CNV 유전변이 분석 실습 Copy Number Variation (CNV) 유전변이의 개념과 분석 방법 CNV 데이터를 활용한 약물 유전체 연구 사례 Y 6 Noncoding 유전변이 분석 실습 비코딩 영역의 유전변이 분석 방법과 중요성 Noncoding 유전변이와 약물 반응의 관련성 연구 사례 Y 7 희귀질환 약물유전체 분석 실습 희귀질환과 관련된 유전변이 분석 방법 희귀질환 치료를 위한 약물유전체 연구 사례 Y 8 약물반응성 유전 연관성 대규모 데이터 분석 실습 대규모 유전체 분석을 위한 분석 플랫폼 실습 대규모 유전체 데이터 형태 학습 Y

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03-01-2024 ~ 12-31-2025

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다. 성명 안준용 소속기관 고려대학교 바이오시스템의과학부 과목명 인공지능을 활용한 전장유전체 유전변이 분석 강의시간 2시간 학습목표 본 강의는 전장유전체 (whole genome sequencing) 분석을 통해 발굴된 유전변이를 해석하는데 사용되는 인공지능 기반의 방법론 등을 학습한다. 유전변이 해석에 필요한 기본개념을 학습하고, 최근 개발된 딥러닝 및 머신러닝 기반의 유전변이 분석 방법을 학습하여 향후 인공지능 기반 유전체 연구 개발에 활용할 수 있는 학습을 제공한다.     강의 선수과목 및 준비사항입니다.      선수과목 차세대 염기서열 분석 – 남진우 교수 Genomics analysis – 김상우 교수 전장유전체 변이 분석의 이해 – 안준용 교수 참고자료 - Avsec (2021), Nature Methods, 18, 1196-1203 준비사항  - 구글 코랩이 연결되는 인터넷    

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03-01-2024 ~ 12-31-2025

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다. 성명 안준용 소속기관 고려대학교 바이오시스템의과학부 과목명 전장유전체 변이 분석의 이해 강의시간 4시간 학습목표 본 강의는 전장유전체 (whole genome sequencing) 분석에 필요한 기본개념을 학습한다. 전장유전체 데이터 분석 및 활용을 위한 분석 플랫폼 Hail 기본개념을 학습하고 실무 모듈을 연습한다. Hail 실습을 통해, 향후 전장유전체 기반 신약개발 및 인공지능 기반 유전체 연구에 필수적인 분석 기본을 학습하고자 한다.   강의 선수과목 및 준비사항입니다.   선수과목 차세대 염기서열 분석 – 남진우 교수 Genomics analysis – 김상우 교수 참고자료  - https://hail.is/ Hail 웹사이트 준비사항  - 구글 코랩이 연결되는 인터넷      

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