[2023] 도킹 프로그램 사용 실습 Certificate

  • Recruiting People1,000 people

  • Enrollment Period04-30-2023 ~ 03-15-2024

  • Learning period04-30-2023 ~ 03-15-2024

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Class Introduction

강좌 소개 및 개요입니다.

성명

홍승환

소속기관

한국제약바이오협회

과목명

도킹 프로그램 사용 실습

강의시간

4

학습목표

도킹에 필요한 단백질 구조를 선택하고, 단백질과 분자 전처리 방법을 설명

도킹 프로그램 (AutoDock Vina 및 변종, rdock 사용 실습

도킹 결과 구조를 분석하는 방법에 대해 설명한다.)

 

강의 선수과목 및 준비사항입니다.

선수과목

protein data bank 분석, SMARTS를 이용한 분자 서브 구조 검색

참고자료

도서, 웹사이트, 논문 등

준비사항

강의에 필요한 환경 등

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Course Introduction

도킹 프로그램 사용 실습 강의 과정입니다. 

1

도킹 실습 환경 설정 (anaconda)

openbabel, AutoDock tools 이용하여 단백질 전처리 및 리간드 초기구조 생성

도킹 프로그램 AutoDock Vina 및 변종 옵션 설명 및 도킹 실습

(Chimera GUI, command line)

2

pdbqt 파일포멧 설명 및 실습

도킹에 필요한 리간드 전처리 코드 작성 실습

docking 구조와 reference 구조 사이의 RMSD 계산 코드 실습

3

다수의 분자에 대한 도킹 시뮬레이션과 도킹 결과 분석을 자동화하는 스크립트 작성 방법을 배운다

Classification
  • Subject
    DTI
  • Class Area
    Chemical & Cheminfonatics
  • Practice
    Software
  • Utilize
    Drug Discovery
Professor