목차

(강의시간)

강의내용

실습여부

교수자

1

게놈 수준 대사 모델링에 대한 배경을 학습하고, 대사 모델링을 위한 Colab 실습 환경을 학습한다.

O

본인

2

게놈 수준 대사 모델링 구축 배경을 학습하고, escher 플랫폼에서 대사 모델링을 실습한다.

O

본인

3

Constraint-based modeling 이론을 학습하고, local 대사 모델링 실습 환경을 구축한다.

O

본인

4

Constraint-based modeling 이론을 학습하고, colab 환경에서 toy 모델을 이용한 대사 모델 및 FBA를 실습한다.

O

본인

5

Genetic perturbation 시 변화되는 대사 흐름 예측 방법론과 이에 관한 실습을 수행한다.

O

본인

6

대사 모델 구축 방법론 이론에 대해 학습하고, 대사 모델 자동화 구축 방법론에 대해 실습한다.

O

본인

7

인체 대사 모델 개발 역사에 대해 학습하고, 대장균 모델을 이용하여 gene essentiality 분석 및 모델 성능 평가 방법을 학습한다.

O

본인

8

인체 대사 모델 구축을 위한 omics integration 방법론에 대해 학습하고, 인체 대사 모델 활용법에 대해 학습한다.

O

본인

9

인체 대사 모델을 구축하고, 암 세포 특이적 대사 모델을 구축하여 gene essentiality 분석을 수행해본다.

O

본인

선수과목

파이썬

참고자료

cobrapy, carveme, 자체 개발 소프트웨어

Notion 강의자료: https://aromatic-ladybug-cd5.notion.site/3b701fb89743803fa56ae60dd767a502

준비사항

대사 시뮬레이션이 가능한 노트북, colab